Geneious Prime分子生物学和序列分析软件详述
时间:2024-01-19 12:19:27
·通过同步原核生物视图高分辨率过滤此表单结果
·量度并尤其同态RNA-seq数据库系统的传达水平
·用作主变成分统计分析和火山图GIS
碱基统计分析
·修剪、拆解和提示Sanger化学合成监视PDF
·不够正基本比对反馈并创建共识碱基
·译文此表现形式、ORF和重写
·量度基因和结构此表达方式
·基于数据库系统库相似度查看的高分辨率标注
·实时转译必需,或揭示译文或挑选出帧的转译
·碱基属性的实时图和统计数据库系统,如pI、分子可量、熔点、AA变成分等
碱基比对
·DNA或核糖体的多重和变成对碱基比对,仅限于仅有原核生物比对
·用作有趣的演算法,仅限于Geneious Aligner、MUSCLE、MAFFT、Clustal Omega、MAUVE和LastZ
·通过高分辨率平移和模版揭示提示和总编辑路线
神经生物学学
·用作Geneious tree builder、MrBayes、PAUP*、PhyML、RAxML等重构竹子
·GIS、总编辑和标明竹子
·交互式间距矩阵提示器
·出版物质量编码器
微卫星统计分析
·为基础原始ABI监视PDF
·微调、量度和手动调整峰值
·Bin峰值为等位基因
·编码器生变成比对等位基因的此表单
分子可了了
·提示真核细胞概要,定时译文载体,并用译文复制粘贴碱基
·一步完变成GoldenGate(IISHG)和限制性了了
·基于同源性的了了,仅限于Gibson、GeneArt和In-Fusion
·TOPO了了
·了了加载的父/后代血缘监视
·密码子简化和反译
·静默突变统计分析,以找到潜在的限制碱基来引入
·CRISPR gDNA的设计
·演示PCR、消化道和连接
COM的设计
·定时的设计PCR和化学合成COM以及杂交探针,以检测任何靶区或整个碱基
·在碱基视图当中平易近人填充COM
·的设计有趣的和简并PCRCOM
·在的设计COM前、期间或之后,填充和删除重构的碱基
·COM特异性测试,以检查COM碱基上的其他结合碱基
数据库系统管理社会活动和重构
·拖放为基础PDF和注册此表,仅限于矢量NTI数据库系统库
·将元数据库系统从电子此表单为基础到碱基和其他XML
·智能NGS为基础功用–一步为基础任何类HG的SAM、BAM、GFF、BED和VCFPDF
·有趣的基于注册此表的建设项目组织
·无缝集变成的交换数据库系统库
·慢速查看数据库系统库当中的所有碱基和元数据库系统
·相当多的导出附加
查看和BLAST
·直接访问NCBI公共BLAST数据库系统库
·专用本地数据库系统库的可选BLAST
·集变成查看外部数据库系统库,仅限于GenBank和UniProt
·直接将碱基上广泛传播GenBank
·在PubMed当中查看文献
·针对本地或交换数据库系统库的高级查看
定时化社会活动迳
·用作GIS总界面创建用于定时批量统计分析的社会活动迳
·用于可执行管道的20多个配有社会活动迳,仅限于将值得注意应用于参考碱基、地图存取、然后查找SNP和随机采样碱基
·通过执笔可选代码社会活动迳来重构功用
API和开发者
• 用作该软件开发工具箱填充专用功用或与其他系统集变成
• 填充您最喜欢的演算法、数据库系统库或GIS
• 包装一个命令行程序以通过Geneious Prime GUI运行
系统期望
Windows:
Windows 7, 8, 8.1, 10 and 11.
Note that 32-bit Windows is not supported for Geneious Prime 2020 and above.
Note: These plugins are not supported on Windows: TopHat, Velvet Optimiser
Note: Use of Spades and the Flye plugin requires Windows 10 with Windows subsystem for Linux installed.
Linux:
Geneious R10 and higher: Ubuntu Desktop LTS (18.04 and 20.04).
Geneious R9 and earlier: Ubuntu Desktop LTS 16.04
Note that 32-bit linux is not supported for Geneious R10 and above.
MacOS:
Supported Apple operating systems vary depending on the version of Geneious you are running, as follows:
Geneious Prime 2020-2022: MacOS 10.11 and higher.
Geneious Prime 2019: MacOS 10.8 - 10.15*
Geneious R10 and R11: MacOS 10.8 - 10.14
Geneious R9: MacOS 10.6 - 10.14. Users on OS 10.6 will need to install Ja 6
Geneious 5.5-8.1: Mac OS 10.6 - 10.11, requires installation of Ja 6
*Only Geneious Prime 2019.2.3. onwards is fully compatible with MacOS Catalina and above.
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